底部过滤(又称：底沙过滤、底层过滤、砂土层过滤器、底层浪板、底板式过滤器)，虽然花费不多，既有效又不需作特别的保养。
底部过滤是放在水族箱底部，它由许多的网板组合而成，在网板上可以连接水泵的进水管，当水泵工作时，水流通过网板的底部的导流槽进入到过滤槽内，过滤后的水再回到水族箱内。底部过滤器最大的优点是过滤面积大，当水泵工作时，底部过滤网与水族箱的底部的空隙中，会产生虹吸作用，形成一股强有力的水流，将网板上的脏物吸到过滤槽内。
底部过滤器还可以根据饲养鱼的大小、水族箱尺寸的大小增加水泵的数量，以增加水的过滤量。底部过滤的使用，抽水泵的功率不能太小，功率太小，底部的水流速太慢，容易滋生藻类，藻类在慢水流中，会大量繁殖。因此，使用底部过滤器时，所使用的过滤器的功率一定要大，这样可以提高底部水的流速，使藻类不能在底部生存。底部过滤器最大的缺点是清洗比较困难!一旦需要清洗过滤器或水族箱，就要将底沙全部取出。
底部过滤 气动：
底部过滤 机动：
另外，与底部过滤相似的有活沙过滤(厚底沙过滤)。
