锦鲤鱼池建好以后，至少48小时（让水泥鱼池风干）以后才可以用水冲洗，冲走残存的水泥、玻璃纤维和其他可能危及锦鲤的杂物。
第一次想鱼池注水时，要使用水表，这样才能得到精确的水容量。这一点很重要，因为之后再锦鲤需要药物治疗时，准确的用药量至关重要。可以购买一个水表，但是，许多锦鲤经销商可以低价出租水表，以内这毕竟是一次性使用的设备。
如果将锦鲤直接放进鱼池中，需要向过滤系统中加入能够启动生物过滤化学物质。因为在早期阶段，过滤系统中没有有益细菌的讯在，无法分解锦鲤产生的氨和硝酸盐等污物。能够启动生物过滤的化学物质可以加速过滤介质的成熟，从而使过滤系统开始其清洁水体的工作。理想的方法是，鱼池注满水后，放入锦鲤前，让整个系统先运行48—72小时，这样可使水温达到环境温度，或者经过加热升温，并使过量的氯气溢散出来。这一过程之后，可以按每天一两条锦鲤的速度，放入鱼池。这样可以避免过滤系统的超负荷运转，使过滤系统有时间调整处理速度，来完成不断增加的过滤任务。即便如此，加入生物过滤器仍是个好办法。另外，如果水没有经过净化，可使用五氯酚去除氯气、氯胺和金属离子。既可以向鱼池的供水箱中加入这种药物，也可以撒在鱼池水面，或者放入水面撇沫器。
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