锦鲤烂鳍烂尾的原因有很多，而大多是因为外伤引起的细菌性烂鳍烂尾。主要是因为锦鲤鱼之间的相互追咬，锦鲤养殖的水质中细菌滋生严重，非裸缸养殖锦鲤造成的刮伤等形成细菌引起的烂鳍烂尾。
首先细菌是如何滋生的，水族箱中空间有限，但是饲养的锦鲤密度大，自然产生的粪便和残食也就相应的增多，已经超出了硝化细菌的工作能力，给水中存在的有危害的细菌增加了食物来源，使其快速的繁殖。还有水质的败坏也致使细菌繁殖迅速。
水体中存在的嗜水气单胞菌、荧光假单细胞和鳗弧菌，还有柱状的粘球菌，这些细菌在恶劣的环境中会侵袭不健康的鱼体。最初表现是鱼鳍的外缘出现轻微的不透明的外观。然后膜会一层，暴露出鱼鳍的一片的脱落刺，鱼鳍、鱼尾就会开始慢慢的裂开。也就形成了我们说的锦鲤烂鳍烂尾。
所以在此建议锦鲤是裸缸养殖，新进锦鲤要隔离消菌杀毒，以免细菌交叉感染，带入水质中更多的细菌。
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