治疗最初必须确认病症，那么锦鲤烂鳍烂尾在发病时期的表现特征有：首先初期鳍的边缘会出现轻微的不透明的外观，然后膜会不断的脱落，暴露出鳍刺，鳍刺再依次的裂开，再不治疗，就会造成锦鲤鱼的死亡。
治疗方法
a，在100千克的水中放呋喃西林粉0.2克进行浸洗消毒，多次用药后可缓解病情。
b，在100千克水中放痢特灵3~5片，浸洗病鱼30分钟。
c，在100千克水中放土霉素5~8片浸洗消毒，可预防感染此病。
d，用低浓度的高锰酸钾溶液浸洗消毒。
e，用庆大霉素浸洗，在100厘米x50厘米x35厘米的水族箱中放2支。
对付烂尾如果一时找不到鱼药，可到药店去买泻痢停(肤腩睉酮)，找一小缸药浴，40CM缸加8片(慢慢搓溶于水)，同时充气。若是热带鱼将水温升到30摄氏度，隔天补加一半药片，效果极佳。一般一周内会康复。
还有轻微的锦鲤烂鳃烂鳍下大盐会有缓解病情的效果，但是如果一旦稍加严重，就必须使用专业药物进行治疗，以防病情扩散恶化。
对于比较严重的烂鳍烂尾，残缺不全的部分要先用剪刀剪去使其平整再使用上述治疗方法进行治疗。
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